清华大学学报(自然科学版)

作者：魏奕新, 韩一蕾, 卢滇楠, 邱彤

单位：1. 清华大学 化学工程系, 北京 100084;<br>2. 工业大数据系统与应用北京市重点实验室, 北京 100084

关键词：合成生物学,生物逆合成,路径评估,层次分析法,生物催化合成

基金：国家重点研发计划项目(2021YFC2103600)\r\n

合成生物学是实现化工绿色化、可持续发展的有效方法之一。代谢途径重构是合成生物学中工业菌种开发与化学品生物催化合成的关键步骤,目的在于确定宿主内合成目标化合物的反应路径与底物,是酶定向进化、实现目标物质生物合成的基础。考虑到生物代谢网络的复杂性,代谢途径重构一般会得到较为庞大的路径结果。为了提高效率、减少无效的实验尝试,合理、有效的路径评估与筛选是重要与必须的。针对已有路径评估方法存在的问题,该文构建了一种生物合成路径评估与排序方法,设计了6个反映路径理论可行性的评估指标,结合层次分析法实现了合理、可解释的路径推荐。通过实例测试,证明了所提出的路径评估方法的有效性。该路径评估方法可降低实验的试错成本,为增加生物逆合成工具的实用性提供了基础。

来源：2023年第5期

《清华大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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